MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 4959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013156	T	6	6	13	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013156	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013156	ATAA	2	8	44	51	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013156	ATT	2	6	74	79	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013156	ATT	2	6	84	89	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013156	TCA	2	6	445	450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013156	AAGG	2	8	464	471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013156	AATT	2	8	499	506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013156	TAA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013156	AT	3	6	1760	1765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013156	CTT	2	6	1775	1780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013156	TAAT	2	8	1782	1789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013156	ATTA	2	8	2605	2612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013156	TA	3	6	2698	2703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013156	TGA	2	6	3055	3060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013156	TTTC	2	8	3066	3073	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013156	AAT	2	6	3097	3102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013156	T	7	7	3180	3186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013156	ATT	2	6	3187	3192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013156	TCA	2	6	3218	3223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013156	TCA	2	6	3269	3274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013156	ATC	3	9	3283	3291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013156	TAA	2	6	3305	3310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013156	A	6	6	3313	3318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013156	CCA	2	6	6672	6677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_013156	ATA	2	6	6796	6801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013156	AATAA	2	10	9282	9291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013156	ATT	2	6	9308	9313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013156	TAT	2	6	11386	11391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013156	TAT	2	6	11614	11619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013156	TAA	4	12	11625	11636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013156	TC	3	6	11650	11655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013156	ATT	2	6	11673	11678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013156	TCA	2	6	14436	14441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013156	GAT	2	6	14471	14476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013156	TAT	2	6	17739	17744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013156	ATTA	2	8	19502	19509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013156	AATT	2	8	19513	19520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013156	TA	4	8	19539	19546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013156	TAAT	2	8	19557	19564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013156	GTT	2	6	21009	21014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013156	TGATTT	2	12	21471	21482	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013156	ATT	2	6	21483	21488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013156	TTA	2	6	21489	21494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013156	TAT	2	6	21506	21511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013156	TATAA	2	10	21524	21533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013156	AT	3	6	21549	21554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013156	TTC	2	6	21560	21565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013156	T	6	6	21604	21609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013156	TAA	2	6	21616	21621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013156	TAT	2	6	21638	21643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013156	T	6	6	21662	21667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013156	A	6	6	21700	21705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013156	TA	3	6	21706	21711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013156	AT	3	6	21725	21730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013156	T	6	6	21753	21758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013156	AT	3	6	21759	21764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013156	ATA	2	6	24034	24039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013156	TTTAA	2	10	24041	24050	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013156	T	6	6	24057	24062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013156	AATT	2	8	24073	24080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013156	TTAT	2	8	24082	24089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013156	TAA	2	6	24100	24105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013156	T	6	6	24115	24120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013156	AAT	2	6	24174	24179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013156	ATA	2	6	24200	24205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013156	TAA	2	6	24671	24676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013156	ACAAA	2	10	27813	27822	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013156	T	6	6	27824	27829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013156	AT	4	8	32385	32392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013156	GGT	2	6	32429	32434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013156	TAA	2	6	32665	32670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013156	T	6	6	32686	32691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013156	TAA	2	6	32700	32705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013156	TTTGA	2	10	32756	32765	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013156	ATT	2	6	33686	33691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013156	AATT	2	8	33707	33714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013156	ATG	2	6	33804	33809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013156	A	6	6	33831	33836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013156	AATT	2	8	33870	33877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013156	A	7	7	33886	33892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013156	ATA	2	6	33904	33909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013156	AGG	2	6	33911	33916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013156	TAG	2	6	33917	33922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013156	ATAAA	2	10	34320	34329	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013156	T	6	6	34349	34354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013156	ATTT	2	8	34361	34368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013156	GA	3	6	34396	34401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013156	T	6	6	34403	34408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013156	ATAA	2	8	34462	34469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013156	T	7	7	35731	35737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013156	AGG	2	6	36846	36851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013156	ATTTTT	2	12	38818	38829	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013156	ATTT	2	8	38831	38838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013156	TAT	2	6	38839	38844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013156	TTTTA	2	10	38845	38854	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013156	ATT	2	6	40093	40098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013156	A	6	6	40125	40130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013156	ATT	2	6	40661	40666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013156	ATTT	2	8	40671	40678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013156	ATTTT	2	10	42393	42402	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013156	T	6	6	42415	42420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013156	AATT	2	8	42450	42457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013156	T	6	6	42470	42475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013156	CAA	2	6	42515	42520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013156	A	6	6	42535	42540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013156	T	6	6	42558	42563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013156	TA	3	6	42583	42588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013156	TA	3	6	42599	42604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013156	AAT	2	6	42686	42691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013156	ATT	2	6	42726	42731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013156	TGT	2	6	42744	42749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013156	TGT	2	6	42753	42758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013156	T	6	6	42839	42844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013156	T	6	6	42882	42887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013156	T	6	6	42898	42903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013156	GAAAT	2	10	42937	42946	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013156	A	6	6	42957	42962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013156	CAC	2	6	44132	44137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_013156	TAT	2	6	44166	44171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013156	TA	3	6	44174	44179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013156	TAA	2	6	45996	46001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013156	TTAA	2	8	46038	46045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013156	AAT	2	6	46047	46052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013156	TTAAT	2	10	46054	46063	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013156	GTT	2	6	46100	46105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013156	TAA	2	6	46209	46214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013156	TATT	2	8	46308	46315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013156	T	9	9	46327	46335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013156	AGA	2	6	46355	46360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013156	CCA	2	6	46384	46389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_013156	TAT	2	6	47493	47498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013156	AGT	2	6	47508	47513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013156	TTA	2	6	47534	47539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013156	T	6	6	48051	48056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013156	A	6	6	48082	48087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013156	ATT	3	9	51991	51999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013156	ACATT	2	10	52077	52086	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_013156	TTC	2	6	56881	56886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013156	ATC	2	6	56915	56920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013156	ACC	2	6	57198	57203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_013156	CCA	2	6	60145	60150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_013156	ATT	3	9	60161	60169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013156	TA	3	6	60192	60197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013156	CAAT	2	8	60213	60220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_013156	ATC	2	6	63290	63295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013156	C	6	6	63295	63300	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
148	NC_013156	AATA	2	8	63301	63308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013156	A	6	6	63308	63313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013156	AT	3	6	63640	63645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013156	TTTA	2	8	63678	63685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_013156	TA	3	6	65499	65504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_013156	A	6	6	67900	67905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_013156	TGA	2	6	78670	78675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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